KEGG气泡图怎么看❓

粉衣小女孩 2024-07-06 16:03:19
⭐气泡图是散点图的一种变体,一般的散点图反映的是两个变量(P值和差异倍数)之间的关系,而气泡图是一种多变量图表(通常是四个变量);气泡图常用于展示基因富集分析的结果,将两个维度的数据值分别映射到坐标轴上,比如例图中纵坐标代表KEGG数据库中对应的通路名称,横坐标代表GeneRatio,每个气泡面积大小代表第三个维度的数据(基因个数),每个气泡的颜色代表第四个维度的数据(P值);气泡图通过气泡的位置、大小和颜色等,可分析数据之间的相关性。 ⭐应用场景:获取到一堆分子,想要看这些分子是否在特定通路中富集,几个分子无须做富集分析~ ⭐数据可视化 先将分子列表进行GOKEGG富集分析,分析后可获得各类目的结果,选取Top6类目进行可视化展示即可;我一般用Python进行分析和可视化,平时我都在夜曲编程学习Python,课程利用生活中通俗易懂的例子讲解Python知识点,很容易就掌握了,非常适合0基础学习,快速掌握Python的语法、数据类型等基本知识点~

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