分享几个常用的零代码在线生信分析工具~
1️⃣GEPIA数据库:这个数据库之前也分享过啦,GEPIA中整理了每一个可检索的基因在不同肿瘤样本中的表达值,可以计算某个基因在某种肿瘤中的表达水平,还可以分析基因与肿瘤预后的关系、基因间的共表达等
2️⃣HPA(The human protein atlas): 是一个样本数据库,收录了正常组织、肿瘤组织与细胞的蛋白表达情况以及肿瘤患者的生存曲线;目前HPA基于蛋白质组学、转录组学和系统生物学数据,来收录细胞、组织和器官中的人类蛋白信息,并提供了每一种蛋白在64个细胞系、48种人类正常组织和20种肿瘤组织中的表达情况;HPA数据库还提供免疫组化图片和带有详细病人临床数据的癌症生存预后信息,图片精美可以直接用于文章发表~
3️⃣TIMER2.0数据库:它是利用RNA-Seq表达谱数据评估肿瘤组织中免疫细胞浸润的数据库;该数据库可以系统的分析不同癌症类型的免疫浸润,不仅能探索基因与肿瘤免疫浸润的关系,还可以探索基因表达和临床预后~
⭐⭐想要更深入的生信学习怎么办❓
在线的生信工具只能解决简单的生信分析,想要更深入的学习生信就要学习代码,零基础怎可以找课程学,「生信猫」从数据清洗到分析及后续写作都可进行一对一辅导,非常适合没有生信基础的研究生们~这两年是孟德尔随机化的发文蓝海,生信猫的课程不仅有生信、meta分析还有孟德尔随机化等,有发文章需求的可以安排哦~







笑傲江湖
好好用!
水果味噗噗
这里面ACC啥子意思啊
娜娜的小鹿
感谢分享