质粒图谱解读及质粒构建❗
粉衣小女孩
2024-09-13 13:52:23
✅质粒图谱怎么看❓
1️⃣复制起点(Ori):Ori表示质粒的复制起点,决定了质粒的宿主和拷贝数。原核生物DNA分子中通常只有一个复制起始点,而真核生物DNA分子有多个复制起始点。
2️⃣转录和复制方向的箭头:质粒图谱上的箭头标识了转录方向和复制起始位点的方向。转录方向由启动子开始的大箭头表示,而复制方向则指示质粒在宿主中的DNA复制方向。
3️⃣标签:包括启动子(如CMV)、抗生素抗性基因(如AmpR)、转录终止位点(如pA)、报告基因(如GFP)等。这些标签有助于了解质粒的功能和应用。
4️⃣多克隆位点(MCS):MCS是一系列限制性内切酶酶切位点,用于插入外源DNA片段。
5️⃣外源DNA插入片段大小:质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。外源片段越长,插入难度越大,稳定性越低,转化效率也越低。
6️⃣表达系统元件:包括启动子、核糖体结合位点、克隆位点和转录终止信号。这些元件有助于区分克隆载体和表达载体,以及确定载体是否适合特定的实验目的。
7️⃣其他元件:包括增强子、沉默子、核糖体结合位点/起始密码、转录终止序列等,它们对基因的表达和调控起着重要作用。
✅质粒构建(Vectorbuilder➕VectorBee)
1️⃣首先要根据实验需求选择合适的质粒载体,可以通过云舟生物的VectorBuilder查询,云舟生物的载体平台有多种载体可供选择,满足不同的实验需求~
2️⃣用VectorBuilder设计质粒图谱,选好载体后添加启动子、目的基因CDS及标签就可以完成设计了,很简单,VectorBuilder中有启动子库和标签库,根据实验选择即可;根据基因名搜索目的基因,系统会推荐用哪个转录本,一个质粒就设计好啦~
3️⃣质粒设计完成后可以下载质粒图谱,也可将后续的质粒合成及慢病毒包装交给云舟生物
4️⃣用云舟生物的免费DNA编辑软件VectorBee可查看质粒序列,包括设计引物用于后续的序列合成,页面简单好操作😊
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切草哥
感谢分享,想了解更多载体构建干货或有相关需求欢迎DD哦~
油腻腻
真诚的问一下博主 能不能把耗材和灭好菌的枪头盒放到一个带盖子的箱子里带出细胞房 用的时候拿回细胞房呀