Nature子刊:AI机器学习模型,精准狙击耐药菌!11月14日,发表在Nature Communications 上的一项新研究显示,科学家成功开发了一种机器学习模型,在检测耐药菌(产谈青霉烯酶肠杆菌)方面标出很高灵敏度。产碳青霉烯酶肠杆菌(CPE)是世卫组织列出的顶级致命耐药菌,2019年仅在欧洲就导致约3.5万人死亡。其检测是全球公共卫生的紧迫挑战。当前,标准的两步检测法(初筛+确认)虽能保证灵敏度,但特异性低,导致大量假阳性分离株进入耗时耗力的确认环节,尤其在面对OXA-48样酶等难检类型时,传统筛查方法效果不佳。为解决此瓶颈,研究人员成功研发了“碳探测器”:一种基于随机森林机器学习模型的新型检测工具。该模型通过分析8种抗生素的抑菌圈直径来预测碳青霉烯酶的产生,其训练数据基于385株经全基因组测序验证的临床肠杆菌分离株。验证结果令人振奋。在外部数据集上,CarbaDetector表现出优异性能:灵敏度达91.2%-96.6%,特异性高达84.4%-87.0%。与传统方法相比,优势显著。例如,应用EUCAST标准于训练集时,虽灵敏度达97.9%,但特异性极低,仅8.2%。而CarbaDetector在保持高灵敏度(96.6%)的同时,将特异性大幅提升至85.0%,这意味着需要进行确认试验的阴性分离株数量减少了六倍,极大地节约了实验室资源。尤为重要的是,即便在部分抗生素测试数据缺失的不完整数据集上,CarbaDetector依然保持稳健性能,展现了强大的实用性和临床适用潜力。该模型已部署为网络应用程序,能快速输出结果,显著缩短检测时间。CarbaDetector的成功开发,标志着AI在临床微生物学应用的重要突破。其高灵敏度与高特异性的平衡,不仅提升了检测效率,更有望优化抗生素使用管理,为遏制耐药菌传播、特别是在资源有限环境中改善CPE检测提供了强有力的创新工具。


